한국의 약도(藥都) 제천시에 위치한 세명대학교 공자학원은 2015년 3월 18일 중국 강서중의약대학과 협력으로 설립되었다. 현재 중국 측 6명, 한국 측 1명 총 7명 직원이 근무하고 있다. 세명대학교 공자학원의 운영 방침과 정체성은 중국어 교육과 문화교류 프로그램을 바탕으로 양교 한중의약학과의 우세와 한중 양국의 ‘약도’ 지역 우세에 의거해 전통 의약 교육, 문화, 학술 분야의 교류와 협력을 광범위하게 전개하여 공자학원을 내실이 갖춰지고 특색이 뚜렷한 국제문화교류의 플랫폼으로 만들기 위해 노력하고 있다. 세명대학교 공자학원은 개원 이래 국제중문교육, 한중 문화교류, 한중 전통의약 협력교류 등을 활발히 진행하고 있다. 중의학의 특색을 가진 공자학원은 중국어 교육 외에도 일련의 문화교류와 한의 의료 및 학술교류 활동을 전개하여 큰 성과를 거두었다. 세명대학교 공자학원은 2017년 제천시청으로부터 감사장을, 2019년 전통의약바이오엑스포 특별공로상을 받았다. 2020년 세명대학교 공자학원은 기존의 공자학원 본부에서 중국국제중문교육기금회로 소속을 옮기는 업무를 완료하였고, 중국국제중문교육기금회, 교육부 중외언어교류협력센터와 양측 협력대학의 전폭적인 지원 아래 기존의 설립 취지와 운영 방침을 견지하며, 세명대학교 발전 계획을 수립해 성실히 실천하고, 코로나19의 영향을 극복하며 중문교육, 중화문화 전파, 양교 사제협력교류 등의 사업을 적극적으로 전개하여 중문교육, 한중문화교류 및 한중전통의약협력교류를 추진하며 혁신적 발전을 도모하고, 중의 특색 있는 학교 모델을 부각시키기 위해 노력하고 있다. 세명대학교 공자학원은 2021년 중국국제중문교육기금회가 주관하는 ‘최고 공자학원(最孔院)’ 동영상 행사에서 우수 조직상을 수상했다.